他也有正当的理由堵上那些朝臣的嘴巴了。
他以为太子还不知道密谋造反的证据已经送到他面前，还打算打太子一个措手不及，殊不知在他收到密信的同时，太子也得知他知晓的事了，是以，太子在他还没下手的时候已经跑了
第二日早朝，太子没来上朝也没有生病或其他消息，等皇帝派人去把东宫找太子却发现太子不在东宫，皇帝心中一凛，心有猜想。
没几日，皇帝的猜想成真了，失踪的太子举兵谋反，他不得不派兵镇压。
等他安排人去领兵镇压叛兵后，又受到一个打击——原本还在京城的安王无声无息回到领地了，他恨得咬牙切齿，后悔没有早点动手，放虎归山，又想派兵把安王富饶的封地夺回来，然而，这只能是想法而不能付诸于行动，现在要对付太子的叛军还要防备鸣凤和鸿威趁虚而入，他根本没有多余的精力和兵力对付安王。
皇帝因求长生不死药忽略了安王，知道安王回到封地他才后悔，他完全不知道安王此次进京已是做好求死的准备，只是安王没想到太子会举兵谋反，不过这对安王来说是好事，他想到自己可以等皇帝和太子两败俱伤后坐享其成，便打消原来的算计，躲回封地等待适合的时机插上一手。
之前一直谣传鸿威和鸣凤要排兵攻打夏晋，哪想到外面没打进来，反倒是夏晋国内打起来了，战争让百姓恐慌，恨不得找个避世的地方躲起来，只可惜安全的避世地方少之又少，要是去到偏僻的地方遇上战乱而趁机窜起的众多盗贼反倒会失去钱财和性命，因此有银子的人都涌到城镇去了，城镇里有官兵镇守，再怎么乱也比荒山野岭和乡下村子安全多了。
南宫祁经常有胡楠基送来的情报，就算他没有离开京城，他也能得知京城以外发生的大事，尤其是两军交战的成败结果。起初，太子在皇帝毫无准备之下举兵谋反占了先机，连打几场都赢了，然而，等皇帝派去的大军达到后，皇帝胜多，太子胜少，虽然皇帝派去的大军扭转了局势，让太子由优势转为劣势，但是由于太子一开始连胜几场占下好几个城，皇帝的大军一时还难以夺回这些城，只能把太子困在相连的几个城里，太子打不出来，但是他们也打不进去。
事实上，南宫祁对他们谁胜谁败没兴趣，他只要一个结果，那就是到最后皇帝和太子都是败，都要死。当然，最后夺得皇位的也不是安王或是其他墨家人，而是鸿威的人，或者该说是鸿威现任的皇帝或……胡楠基，就算安王打败皇帝和太子坐上皇位，这也是短暂的，而不是最后南宫祁所期望的最后结果。
南宫祁虽看胡楠基带给他的情报，却没多在意皇帝和太子的成败结果，他庆幸的是皇帝没有派南宫洪仁领兵去镇压太子。皇帝对忌惮南宫洪仁并且不信任他，是以没有点南宫洪仁领军，这却是南宫祁所希望的，他不愿南宫洪仁再帮皇室，也不愿他们搅入夏晋的内战里，只愿他们是个局外人，冷眼旁观夏晋如何覆灭。
皇帝最近所做的决定让南宫祁很高兴，不过他的高兴没维持多久，他收到皇宫的密探——鸟儿送回的情报，钦天监监正向皇帝建议找借口请他住进宫里为皇帝出谋献策。
南宫祁得知这个消息后，终于下决心做心里曾经考虑过但是之前没有做的事——逃离京城